Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
FarsaQ8C0C7 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
FarsaQ8C0C7 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
FarsaQ8C0C7 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
FarsaQ8C0C7 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
FarsaQ8C0C7 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
FarsaQ8C0C7 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
FarsaQ8C0C7 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
FarsaQ8C0C7 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
FarsaQ8C0C7 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
FarsaQ8C0C7 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
FarsaQ8C0C7 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
FarsaQ8C0C7 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
FarsaQ8C0C7 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
FarsaQ8C0C7 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
FarsaQ8C0C7 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
FarsaQ8C0C7 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
FarsaQ8C0C7 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
FarsaQ8C0C7 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
FarsaQ8C0C7 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
FarsaQ8C0C7 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
FarsaQ8C0C7 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
FarsaQ8C0C7 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
FarsaQ8C0C7 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
FarsaQ8C0C7 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
FarsaQ8C0C7 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
FarsaQ8C0C7 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
FarsaQ8C0C7 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
FarsaQ8C0C7 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
FarsaQ8C0C7 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
FarsaQ8C0C7 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
FarsaQ8C0C7 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
FarsaQ8C0C7 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
FarsaQ8C0C7 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
FarsaQ8C0C7 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
FarsaQ8C0C7 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
FarsaQ8C0C7 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
FarsaQ8C0C7 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
FarsaQ8C0C7 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
FarsaQ8C0C7 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
FarsaQ8C0C7 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
FarsaQ8C0C7 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
FarsaQ8C0C7 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
FarsaQ8C0C7 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
FarsaQ8C0C7 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
FarsaQ8C0C7 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
FarsaQ8C0C7 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
FarsaQ8C0C7 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
FarsaQ8C0C7 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
FarsaQ8C0C7 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
FarsaQ8C0C7 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
FarsaQ8C0C7 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
FarsaQ8C0C7 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
FarsaQ8C0C7 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
FarsaQ8C0C7 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
FarsaQ8C0C7 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
FarsaQ8C0C7 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
FarsaQ8C0C7 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
FarsaQ8C0C7 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
FarsaQ8C0C7 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
FarsaQ8C0C7 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
FarsaQ8C0C7 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
FarsaQ8C0C7 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
FarsaQ8C0C7 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
FarsaQ8C0C7 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
FarsaQ8C0C7 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
FarsaQ8C0C7 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
FarsaQ8C0C7 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
FarsaQ8C0C7 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
FarsaQ8C0C7 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
FarsaQ8C0C7 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
FarsaQ8C0C7 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
FarsaQ8C0C7 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
FarsaQ8C0C7 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
FarsaQ8C0C7 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
FarsaQ8C0C7 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
FarsaQ8C0C7 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
FarsaQ8C0C7 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
FarsaQ8C0C7 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
FarsaQ8C0C7 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
FarsaQ8C0C7 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
FarsaQ8C0C7 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
FarsaQ8C0C7 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
FarsaQ8C0C7 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
FarsaQ8C0C7 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
FarsaQ8C0C7 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
FarsaQ8C0C7 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
FarsaQ8C0C7 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
FarsaQ8C0C7 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
FarsaQ8C0C7 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
FarsaQ8C0C7 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
FarsaQ8C0C7 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
FarsaQ8C0C7 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
FarsaQ8C0C7 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
FarsaQ8C0C7 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
FarsaQ8C0C7 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
FarsaQ8C0C7 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
FarsaQ8C0C7 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
FarsaQ8C0C7 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
FarsaQ8C0C7 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms