Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXS2

Tnfsfm13, Tumor necrosis factor (ligand) superfamily, membrane-bound member 13, mousemouse

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Length 410 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfsfm13Q8BXS2 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfsfm13Q8BXS2 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfsfm13Q8BXS2 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfsfm13Q8BXS2 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfsfm13Q8BXS2 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfsfm13Q8BXS2 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfsfm13Q8BXS2 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfsfm13Q8BXS2 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfsfm13Q8BXS2 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfsfm13Q8BXS2 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfsfm13Q8BXS2 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfsfm13Q8BXS2 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfsfm13Q8BXS2 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfsfm13Q8BXS2 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfsfm13Q8BXS2 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfsfm13Q8BXS2 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfsfm13Q8BXS2 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfsfm13Q8BXS2 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfsfm13Q8BXS2 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfsfm13Q8BXS2 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfsfm13Q8BXS2 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfsfm13Q8BXS2 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfsfm13Q8BXS2 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfsfm13Q8BXS2 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfsfm13Q8BXS2 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfsfm13Q8BXS2 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfsfm13Q8BXS2 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfsfm13Q8BXS2 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfsfm13Q8BXS2 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfsfm13Q8BXS2 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfsfm13Q8BXS2 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfsfm13Q8BXS2 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfsfm13Q8BXS2 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfsfm13Q8BXS2 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfsfm13Q8BXS2 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfsfm13Q8BXS2 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfsfm13Q8BXS2 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfsfm13Q8BXS2 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfsfm13Q8BXS2 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfsfm13Q8BXS2 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsfm13Q8BXS2 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsfm13Q8BXS2 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsfm13Q8BXS2 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsfm13Q8BXS2 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsfm13Q8BXS2 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsfm13Q8BXS2 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsfm13Q8BXS2 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsfm13Q8BXS2 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsfm13Q8BXS2 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsfm13Q8BXS2 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsfm13Q8BXS2 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsfm13Q8BXS2 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Tnfsfm13Q8BXS2 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsfm13Q8BXS2 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Tnfsfm13Q8BXS2 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Tnfsfm13Q8BXS2 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Tnfsfm13Q8BXS2 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsfm13Q8BXS2 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsfm13Q8BXS2 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsfm13Q8BXS2 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsfm13Q8BXS2 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsfm13Q8BXS2 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsfm13Q8BXS2 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsfm13Q8BXS2 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsfm13Q8BXS2 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsfm13Q8BXS2 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsfm13Q8BXS2 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsfm13Q8BXS2 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsfm13Q8BXS2 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsfm13Q8BXS2 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsfm13Q8BXS2 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfsfm13Q8BXS2 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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