Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSU2

Cxcl16, C-X-C motif chemokine 16, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl16Q8BSU2 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cxcl16Q8BSU2 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms