Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

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Length 910 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smarcal1Q8BJL0 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smarcal1Q8BJL0 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smarcal1Q8BJL0 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smarcal1Q8BJL0 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Smarcal1Q8BJL0 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smarcal1Q8BJL0 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smarcal1Q8BJL0 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smarcal1Q8BJL0 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smarcal1Q8BJL0 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smarcal1Q8BJL0 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smarcal1Q8BJL0 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smarcal1Q8BJL0 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smarcal1Q8BJL0 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smarcal1Q8BJL0 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smarcal1Q8BJL0 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smarcal1Q8BJL0 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smarcal1Q8BJL0 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smarcal1Q8BJL0 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smarcal1Q8BJL0 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smarcal1Q8BJL0 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smarcal1Q8BJL0 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smarcal1Q8BJL0 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smarcal1Q8BJL0 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smarcal1Q8BJL0 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smarcal1Q8BJL0 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smarcal1Q8BJL0 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smarcal1Q8BJL0 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Smarcal1Q8BJL0 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smarcal1Q8BJL0 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smarcal1Q8BJL0 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smarcal1Q8BJL0 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smarcal1Q8BJL0 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smarcal1Q8BJL0 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Smarcal1Q8BJL0 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smarcal1Q8BJL0 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smarcal1Q8BJL0 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smarcal1Q8BJL0 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smarcal1Q8BJL0 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smarcal1Q8BJL0 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smarcal1Q8BJL0 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smarcal1Q8BJL0 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smarcal1Q8BJL0 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smarcal1Q8BJL0 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smarcal1Q8BJL0 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smarcal1Q8BJL0 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Smarcal1Q8BJL0 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smarcal1Q8BJL0 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smarcal1Q8BJL0 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smarcal1Q8BJL0 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smarcal1Q8BJL0 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smarcal1Q8BJL0 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smarcal1Q8BJL0 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smarcal1Q8BJL0 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smarcal1Q8BJL0 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Smarcal1Q8BJL0 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smarcal1Q8BJL0 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smarcal1Q8BJL0 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Smarcal1Q8BJL0 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smarcal1Q8BJL0 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smarcal1Q8BJL0 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smarcal1Q8BJL0 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smarcal1Q8BJL0 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smarcal1Q8BJL0 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Smarcal1Q8BJL0 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smarcal1Q8BJL0 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smarcal1Q8BJL0 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smarcal1Q8BJL0 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smarcal1Q8BJL0 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smarcal1Q8BJL0 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smarcal1Q8BJL0 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smarcal1Q8BJL0 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smarcal1Q8BJL0 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smarcal1Q8BJL0 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smarcal1Q8BJL0 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smarcal1Q8BJL0 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smarcal1Q8BJL0 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smarcal1Q8BJL0 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smarcal1Q8BJL0 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smarcal1Q8BJL0 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smarcal1Q8BJL0 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smarcal1Q8BJL0 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smarcal1Q8BJL0 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smarcal1Q8BJL0 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smarcal1Q8BJL0 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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