Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ubash3bQ8BGG7 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 4933401J01Rik-201ENSMUST00000193812 1070 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ubash3bQ8BGG7 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
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