Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW5

H2-M10.6, Histocompatibility 2, M region locus 10.6, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.6Q85ZW5 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-M10.6Q85ZW5 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
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