Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 4930502E09Rik-201ENSMUST00000126016 755 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Gm13965-201ENSMUST00000154834 576 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Ttc28Q80XJ3 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Acot13-201ENSMUST00000006900 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Ttc28Q80XJ3 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Ttc28Q80XJ3 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Ttc28Q80XJ3 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Cd55b-202ENSMUST00000119432 986 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
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