Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH7

Kcnf1, Potassium voltage-gated channel subfamily F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnf1Q7TSH7 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Kcnf1Q7TSH7 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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