Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Dsg1bQ7TSF1 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Dsg1bQ7TSF1 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Dsg1bQ7TSF1 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Dsg1bQ7TSF1 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Dsg1bQ7TSF1 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Dsg1bQ7TSF1 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Dsg1bQ7TSF1 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Dsg1bQ7TSF1 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Dsg1bQ7TSF1 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Dsg1bQ7TSF1 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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