Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSC1

Prrc2a, Protein PRRC2A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2aQ7TSC1 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prrc2aQ7TSC1 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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