Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ95

Lnpk, Endoplasmic reticulum junction formation protein lunapark, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LnpkQ7TQ95 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
LnpkQ7TQ95 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
LnpkQ7TQ95 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LnpkQ7TQ95 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
LnpkQ7TQ95 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LnpkQ7TQ95 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LnpkQ7TQ95 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LnpkQ7TQ95 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LnpkQ7TQ95 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
LnpkQ7TQ95 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LnpkQ7TQ95 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LnpkQ7TQ95 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
LnpkQ7TQ95 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LnpkQ7TQ95 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LnpkQ7TQ95 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LnpkQ7TQ95 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LnpkQ7TQ95 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LnpkQ7TQ95 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LnpkQ7TQ95 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LnpkQ7TQ95 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LnpkQ7TQ95 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LnpkQ7TQ95 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LnpkQ7TQ95 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LnpkQ7TQ95 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LnpkQ7TQ95 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LnpkQ7TQ95 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LnpkQ7TQ95 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LnpkQ7TQ95 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LnpkQ7TQ95 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LnpkQ7TQ95 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LnpkQ7TQ95 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LnpkQ7TQ95 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LnpkQ7TQ95 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LnpkQ7TQ95 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LnpkQ7TQ95 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LnpkQ7TQ95 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LnpkQ7TQ95 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LnpkQ7TQ95 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LnpkQ7TQ95 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LnpkQ7TQ95 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LnpkQ7TQ95 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LnpkQ7TQ95 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LnpkQ7TQ95 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LnpkQ7TQ95 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LnpkQ7TQ95 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LnpkQ7TQ95 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LnpkQ7TQ95 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
LnpkQ7TQ95 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
LnpkQ7TQ95 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LnpkQ7TQ95 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LnpkQ7TQ95 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LnpkQ7TQ95 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LnpkQ7TQ95 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LnpkQ7TQ95 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LnpkQ7TQ95 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LnpkQ7TQ95 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LnpkQ7TQ95 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LnpkQ7TQ95 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LnpkQ7TQ95 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LnpkQ7TQ95 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
LnpkQ7TQ95 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LnpkQ7TQ95 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LnpkQ7TQ95 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
LnpkQ7TQ95 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LnpkQ7TQ95 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LnpkQ7TQ95 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LnpkQ7TQ95 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LnpkQ7TQ95 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LnpkQ7TQ95 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LnpkQ7TQ95 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LnpkQ7TQ95 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LnpkQ7TQ95 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LnpkQ7TQ95 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LnpkQ7TQ95 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LnpkQ7TQ95 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LnpkQ7TQ95 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LnpkQ7TQ95 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LnpkQ7TQ95 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LnpkQ7TQ95 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LnpkQ7TQ95 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LnpkQ7TQ95 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LnpkQ7TQ95 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LnpkQ7TQ95 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
LnpkQ7TQ95 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
LnpkQ7TQ95 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LnpkQ7TQ95 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
LnpkQ7TQ95 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LnpkQ7TQ95 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LnpkQ7TQ95 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LnpkQ7TQ95 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LnpkQ7TQ95 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LnpkQ7TQ95 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LnpkQ7TQ95 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LnpkQ7TQ95 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
LnpkQ7TQ95 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LnpkQ7TQ95 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LnpkQ7TQ95 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LnpkQ7TQ95 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
LnpkQ7TQ95 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
LnpkQ7TQ95 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms