Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Actn1Q7TPR4 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms