Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

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Length 92 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim12Q78RX3 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
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