Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Gm45500-201ENSMUST00000211676 803 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Topbp1Q6ZQF0 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms