Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9P0

Slf2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slf2Q6P9P0 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slf2Q6P9P0 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slf2Q6P9P0 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slf2Q6P9P0 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slf2Q6P9P0 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slf2Q6P9P0 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slf2Q6P9P0 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slf2Q6P9P0 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slf2Q6P9P0 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slf2Q6P9P0 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slf2Q6P9P0 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slf2Q6P9P0 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Slf2Q6P9P0 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slf2Q6P9P0 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slf2Q6P9P0 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Slf2Q6P9P0 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Slf2Q6P9P0 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slf2Q6P9P0 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slf2Q6P9P0 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slf2Q6P9P0 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slf2Q6P9P0 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slf2Q6P9P0 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slf2Q6P9P0 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slf2Q6P9P0 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Slf2Q6P9P0 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slf2Q6P9P0 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Slf2Q6P9P0 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slf2Q6P9P0 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slf2Q6P9P0 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slf2Q6P9P0 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slf2Q6P9P0 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Slf2Q6P9P0 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slf2Q6P9P0 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slf2Q6P9P0 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slf2Q6P9P0 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slf2Q6P9P0 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slf2Q6P9P0 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slf2Q6P9P0 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slf2Q6P9P0 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slf2Q6P9P0 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slf2Q6P9P0 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slf2Q6P9P0 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slf2Q6P9P0 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slf2Q6P9P0 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slf2Q6P9P0 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slf2Q6P9P0 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slf2Q6P9P0 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slf2Q6P9P0 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slf2Q6P9P0 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slf2Q6P9P0 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slf2Q6P9P0 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slf2Q6P9P0 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slf2Q6P9P0 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slf2Q6P9P0 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slf2Q6P9P0 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Slf2Q6P9P0 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Slf2Q6P9P0 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slf2Q6P9P0 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slf2Q6P9P0 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slf2Q6P9P0 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slf2Q6P9P0 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slf2Q6P9P0 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slf2Q6P9P0 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slf2Q6P9P0 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slf2Q6P9P0 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slf2Q6P9P0 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slf2Q6P9P0 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Slf2Q6P9P0 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slf2Q6P9P0 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slf2Q6P9P0 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slf2Q6P9P0 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slf2Q6P9P0 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slf2Q6P9P0 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slf2Q6P9P0 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slf2Q6P9P0 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slf2Q6P9P0 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slf2Q6P9P0 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slf2Q6P9P0 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slf2Q6P9P0 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slf2Q6P9P0 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slf2Q6P9P0 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slf2Q6P9P0 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slf2Q6P9P0 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slf2Q6P9P0 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slf2Q6P9P0 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Slf2Q6P9P0 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slf2Q6P9P0 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Slf2Q6P9P0 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slf2Q6P9P0 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slf2Q6P9P0 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slf2Q6P9P0 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slf2Q6P9P0 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slf2Q6P9P0 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slf2Q6P9P0 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slf2Q6P9P0 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slf2Q6P9P0 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slf2Q6P9P0 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slf2Q6P9P0 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slf2Q6P9P0 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slf2Q6P9P0 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms