Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ParpbpQ6IRT3 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ParpbpQ6IRT3 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ParpbpQ6IRT3 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ParpbpQ6IRT3 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ParpbpQ6IRT3 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ParpbpQ6IRT3 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ParpbpQ6IRT3 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ParpbpQ6IRT3 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ParpbpQ6IRT3 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ParpbpQ6IRT3 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ParpbpQ6IRT3 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ParpbpQ6IRT3 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ParpbpQ6IRT3 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ParpbpQ6IRT3 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ParpbpQ6IRT3 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ParpbpQ6IRT3 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ParpbpQ6IRT3 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ParpbpQ6IRT3 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ParpbpQ6IRT3 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ParpbpQ6IRT3 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ParpbpQ6IRT3 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ParpbpQ6IRT3 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ParpbpQ6IRT3 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ParpbpQ6IRT3 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ParpbpQ6IRT3 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ParpbpQ6IRT3 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ParpbpQ6IRT3 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ParpbpQ6IRT3 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ParpbpQ6IRT3 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ParpbpQ6IRT3 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ParpbpQ6IRT3 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ParpbpQ6IRT3 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ParpbpQ6IRT3 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ParpbpQ6IRT3 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ParpbpQ6IRT3 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ParpbpQ6IRT3 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ParpbpQ6IRT3 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ParpbpQ6IRT3 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ParpbpQ6IRT3 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ParpbpQ6IRT3 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ParpbpQ6IRT3 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ParpbpQ6IRT3 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ParpbpQ6IRT3 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ParpbpQ6IRT3 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ParpbpQ6IRT3 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ParpbpQ6IRT3 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ParpbpQ6IRT3 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ParpbpQ6IRT3 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ParpbpQ6IRT3 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ParpbpQ6IRT3 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ParpbpQ6IRT3 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ParpbpQ6IRT3 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ParpbpQ6IRT3 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ParpbpQ6IRT3 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ParpbpQ6IRT3 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ParpbpQ6IRT3 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ParpbpQ6IRT3 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ParpbpQ6IRT3 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ParpbpQ6IRT3 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ParpbpQ6IRT3 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ParpbpQ6IRT3 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
ParpbpQ6IRT3 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ParpbpQ6IRT3 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ParpbpQ6IRT3 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
ParpbpQ6IRT3 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ParpbpQ6IRT3 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ParpbpQ6IRT3 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ParpbpQ6IRT3 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ParpbpQ6IRT3 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
ParpbpQ6IRT3 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ParpbpQ6IRT3 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ParpbpQ6IRT3 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ParpbpQ6IRT3 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
ParpbpQ6IRT3 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
ParpbpQ6IRT3 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ParpbpQ6IRT3 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ParpbpQ6IRT3 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ParpbpQ6IRT3 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ParpbpQ6IRT3 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
ParpbpQ6IRT3 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
ParpbpQ6IRT3 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ParpbpQ6IRT3 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ParpbpQ6IRT3 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ParpbpQ6IRT3 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ParpbpQ6IRT3 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ParpbpQ6IRT3 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ParpbpQ6IRT3 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ParpbpQ6IRT3 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ParpbpQ6IRT3 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ParpbpQ6IRT3 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ParpbpQ6IRT3 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ParpbpQ6IRT3 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ParpbpQ6IRT3 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ParpbpQ6IRT3 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ParpbpQ6IRT3 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ParpbpQ6IRT3 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ParpbpQ6IRT3 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ParpbpQ6IRT3 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ParpbpQ6IRT3 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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