Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Krt39Q6IFX4 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Krt39Q6IFX4 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Krt39Q6IFX4 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Krt39Q6IFX4 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Krt39Q6IFX4 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Krt39Q6IFX4 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Krt39Q6IFX4 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Krt39Q6IFX4 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Krt39Q6IFX4 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Krt39Q6IFX4 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Krt39Q6IFX4 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Krt39Q6IFX4 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Krt39Q6IFX4 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Krt39Q6IFX4 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Krt39Q6IFX4 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Krt39Q6IFX4 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Krt39Q6IFX4 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Krt39Q6IFX4 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Krt39Q6IFX4 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Krt39Q6IFX4 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Krt39Q6IFX4 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Krt39Q6IFX4 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Krt39Q6IFX4 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Krt39Q6IFX4 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Krt39Q6IFX4 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Krt39Q6IFX4 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Krt39Q6IFX4 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Krt39Q6IFX4 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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