Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt40Q6IFX3 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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