Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

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Length 922 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Atg9bQ6EBV9 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg9bQ6EBV9 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg9bQ6EBV9 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg9bQ6EBV9 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg9bQ6EBV9 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Atg9bQ6EBV9 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Atg9bQ6EBV9 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg9bQ6EBV9 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg9bQ6EBV9 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg9bQ6EBV9 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg9bQ6EBV9 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Atg9bQ6EBV9 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Atg9bQ6EBV9 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg9bQ6EBV9 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Atg9bQ6EBV9 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Atg9bQ6EBV9 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg9bQ6EBV9 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg9bQ6EBV9 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Atg9bQ6EBV9 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Atg9bQ6EBV9 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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Atg9bQ6EBV9 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg9bQ6EBV9 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Atg9bQ6EBV9 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg9bQ6EBV9 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg9bQ6EBV9 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg9bQ6EBV9 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg9bQ6EBV9 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg9bQ6EBV9 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg9bQ6EBV9 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg9bQ6EBV9 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg9bQ6EBV9 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg9bQ6EBV9 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg9bQ6EBV9 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg9bQ6EBV9 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg9bQ6EBV9 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg9bQ6EBV9 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg9bQ6EBV9 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg9bQ6EBV9 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg9bQ6EBV9 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg9bQ6EBV9 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg9bQ6EBV9 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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