Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Q6DFW0 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Q6DFW0 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Q6DFW0 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Q6DFW0 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q6DFW0 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q6DFW0 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q6DFW0 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q6DFW0 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms