Protein–RNA interactions for Protein: Q64705

Usf2, Upstream stimulatory factor 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf2Q64705 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Nek4-207ENSMUST00000228328 4245 ntAPPRIS P2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Usf2Q64705 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usf2Q64705 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms