Protein–RNA interactions for Protein: Q64674

Srm, Spermidine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrmQ64674 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SrmQ64674 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SrmQ64674 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SrmQ64674 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SrmQ64674 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SrmQ64674 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SrmQ64674 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
SrmQ64674 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
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SrmQ64674 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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SrmQ64674 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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SrmQ64674 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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SrmQ64674 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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SrmQ64674 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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SrmQ64674 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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SrmQ64674 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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SrmQ64674 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrmQ64674 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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SrmQ64674 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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SrmQ64674 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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SrmQ64674 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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SrmQ64674 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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SrmQ64674 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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SrmQ64674 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
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SrmQ64674 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrmQ64674 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrmQ64674 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SrmQ64674 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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