Protein–RNA interactions for Protein: Q64347

Clcn1, Chloride channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 994 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn1Q64347 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Clcn1Q64347 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Clcn1Q64347 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clcn1Q64347 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clcn1Q64347 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clcn1Q64347 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clcn1Q64347 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Clcn1Q64347 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Clcn1Q64347 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Clcn1Q64347 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Clcn1Q64347 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clcn1Q64347 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Clcn1Q64347 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clcn1Q64347 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clcn1Q64347 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clcn1Q64347 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clcn1Q64347 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clcn1Q64347 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clcn1Q64347 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clcn1Q64347 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clcn1Q64347 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clcn1Q64347 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clcn1Q64347 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clcn1Q64347 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clcn1Q64347 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clcn1Q64347 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clcn1Q64347 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clcn1Q64347 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clcn1Q64347 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clcn1Q64347 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clcn1Q64347 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clcn1Q64347 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clcn1Q64347 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clcn1Q64347 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clcn1Q64347 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clcn1Q64347 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clcn1Q64347 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clcn1Q64347 Gm9519-201ENSMUST00000206108 1337 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Clcn1Q64347 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clcn1Q64347 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clcn1Q64347 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clcn1Q64347 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clcn1Q64347 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clcn1Q64347 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clcn1Q64347 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clcn1Q64347 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Clcn1Q64347 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Clcn1Q64347 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clcn1Q64347 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Clcn1Q64347 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Clcn1Q64347 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clcn1Q64347 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Clcn1Q64347 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Clcn1Q64347 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clcn1Q64347 Prl8a1-201ENSMUST00000006664 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clcn1Q64347 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clcn1Q64347 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clcn1Q64347 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clcn1Q64347 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clcn1Q64347 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clcn1Q64347 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clcn1Q64347 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clcn1Q64347 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clcn1Q64347 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clcn1Q64347 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clcn1Q64347 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clcn1Q64347 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clcn1Q64347 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clcn1Q64347 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clcn1Q64347 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clcn1Q64347 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clcn1Q64347 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clcn1Q64347 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clcn1Q64347 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clcn1Q64347 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Clcn1Q64347 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clcn1Q64347 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clcn1Q64347 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clcn1Q64347 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clcn1Q64347 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Clcn1Q64347 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clcn1Q64347 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clcn1Q64347 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clcn1Q64347 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clcn1Q64347 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clcn1Q64347 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clcn1Q64347 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Clcn1Q64347 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clcn1Q64347 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Clcn1Q64347 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clcn1Q64347 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clcn1Q64347 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clcn1Q64347 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clcn1Q64347 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clcn1Q64347 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Clcn1Q64347 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clcn1Q64347 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Clcn1Q64347 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clcn1Q64347 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clcn1Q64347 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms