Protein–RNA interactions for Protein: Q61550

Rad21, Double-strand-break repair protein rad21 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad21Q61550 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad21Q61550 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad21Q61550 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad21Q61550 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad21Q61550 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad21Q61550 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad21Q61550 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad21Q61550 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad21Q61550 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad21Q61550 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad21Q61550 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad21Q61550 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad21Q61550 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad21Q61550 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad21Q61550 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad21Q61550 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad21Q61550 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad21Q61550 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad21Q61550 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad21Q61550 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad21Q61550 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad21Q61550 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad21Q61550 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad21Q61550 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad21Q61550 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad21Q61550 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad21Q61550 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad21Q61550 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad21Q61550 AC132446.1-201ENSMUST00000222655 226 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad21Q61550 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad21Q61550 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad21Q61550 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad21Q61550 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad21Q61550 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad21Q61550 Vrk1-204ENSMUST00000220629 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad21Q61550 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad21Q61550 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad21Q61550 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad21Q61550 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad21Q61550 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad21Q61550 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad21Q61550 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad21Q61550 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad21Q61550 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad21Q61550 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad21Q61550 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad21Q61550 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad21Q61550 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad21Q61550 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad21Q61550 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad21Q61550 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad21Q61550 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad21Q61550 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad21Q61550 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad21Q61550 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad21Q61550 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad21Q61550 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad21Q61550 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad21Q61550 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad21Q61550 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad21Q61550 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad21Q61550 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad21Q61550 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad21Q61550 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad21Q61550 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad21Q61550 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad21Q61550 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad21Q61550 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad21Q61550 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad21Q61550 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad21Q61550 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad21Q61550 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad21Q61550 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad21Q61550 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad21Q61550 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad21Q61550 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad21Q61550 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad21Q61550 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad21Q61550 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad21Q61550 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad21Q61550 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad21Q61550 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad21Q61550 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad21Q61550 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad21Q61550 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad21Q61550 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad21Q61550 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad21Q61550 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad21Q61550 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad21Q61550 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad21Q61550 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad21Q61550 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad21Q61550 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad21Q61550 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad21Q61550 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad21Q61550 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad21Q61550 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad21Q61550 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad21Q61550 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad21Q61550 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms