Protein–RNA interactions for Protein: Q61510

Trim25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim25Q61510 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim25Q61510 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim25Q61510 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim25Q61510 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim25Q61510 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim25Q61510 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim25Q61510 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim25Q61510 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim25Q61510 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim25Q61510 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim25Q61510 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim25Q61510 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim25Q61510 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim25Q61510 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim25Q61510 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim25Q61510 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim25Q61510 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim25Q61510 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim25Q61510 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim25Q61510 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim25Q61510 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim25Q61510 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim25Q61510 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim25Q61510 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim25Q61510 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim25Q61510 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim25Q61510 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim25Q61510 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim25Q61510 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim25Q61510 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim25Q61510 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim25Q61510 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim25Q61510 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim25Q61510 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim25Q61510 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim25Q61510 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim25Q61510 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim25Q61510 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim25Q61510 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim25Q61510 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim25Q61510 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim25Q61510 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim25Q61510 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim25Q61510 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim25Q61510 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim25Q61510 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim25Q61510 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim25Q61510 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim25Q61510 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim25Q61510 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim25Q61510 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim25Q61510 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim25Q61510 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim25Q61510 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim25Q61510 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim25Q61510 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim25Q61510 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim25Q61510 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim25Q61510 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim25Q61510 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim25Q61510 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim25Q61510 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim25Q61510 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim25Q61510 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim25Q61510 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim25Q61510 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim25Q61510 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim25Q61510 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim25Q61510 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim25Q61510 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim25Q61510 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim25Q61510 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim25Q61510 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim25Q61510 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim25Q61510 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim25Q61510 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim25Q61510 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim25Q61510 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim25Q61510 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim25Q61510 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim25Q61510 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim25Q61510 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim25Q61510 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim25Q61510 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim25Q61510 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Trim25Q61510 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Trim25Q61510 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Trim25Q61510 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Trim25Q61510 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim25Q61510 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim25Q61510 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim25Q61510 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim25Q61510 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim25Q61510 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim25Q61510 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim25Q61510 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim25Q61510 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim25Q61510 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim25Q61510 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim25Q61510 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.1 ms