Protein–RNA interactions for Protein: Q61457

Ccne1, G1/S-specific cyclin-E1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne1Q61457 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccne1Q61457 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccne1Q61457 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccne1Q61457 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccne1Q61457 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccne1Q61457 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccne1Q61457 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccne1Q61457 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccne1Q61457 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccne1Q61457 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccne1Q61457 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccne1Q61457 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccne1Q61457 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccne1Q61457 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccne1Q61457 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccne1Q61457 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccne1Q61457 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccne1Q61457 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccne1Q61457 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccne1Q61457 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccne1Q61457 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccne1Q61457 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccne1Q61457 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccne1Q61457 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccne1Q61457 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccne1Q61457 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccne1Q61457 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccne1Q61457 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccne1Q61457 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccne1Q61457 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccne1Q61457 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccne1Q61457 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccne1Q61457 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccne1Q61457 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccne1Q61457 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccne1Q61457 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccne1Q61457 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccne1Q61457 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccne1Q61457 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccne1Q61457 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccne1Q61457 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccne1Q61457 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccne1Q61457 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccne1Q61457 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccne1Q61457 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccne1Q61457 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccne1Q61457 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccne1Q61457 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccne1Q61457 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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