Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Traf3Q60803 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Traf3Q60803 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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