Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Csnk2a1Q60737 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Csnk2a1Q60737 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Csnk2a1Q60737 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Csnk2a1Q60737 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Csnk2a1Q60737 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Csnk2a1Q60737 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Csnk2a1Q60737 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Csnk2a1Q60737 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Csnk2a1Q60737 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Csnk2a1Q60737 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Csnk2a1Q60737 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Csnk2a1Q60737 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Csnk2a1Q60737 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Csnk2a1Q60737 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Csnk2a1Q60737 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Csnk2a1Q60737 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Csnk2a1Q60737 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Csnk2a1Q60737 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Csnk2a1Q60737 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Csnk2a1Q60737 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Csnk2a1Q60737 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Csnk2a1Q60737 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Csnk2a1Q60737 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Csnk2a1Q60737 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Csnk2a1Q60737 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Csnk2a1Q60737 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Csnk2a1Q60737 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Csnk2a1Q60737 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Csnk2a1Q60737 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Csnk2a1Q60737 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Csnk2a1Q60737 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Csnk2a1Q60737 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Csnk2a1Q60737 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Csnk2a1Q60737 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Csnk2a1Q60737 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Csnk2a1Q60737 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Csnk2a1Q60737 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Csnk2a1Q60737 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Csnk2a1Q60737 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Csnk2a1Q60737 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Csnk2a1Q60737 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Csnk2a1Q60737 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Csnk2a1Q60737 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Csnk2a1Q60737 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Csnk2a1Q60737 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Csnk2a1Q60737 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Csnk2a1Q60737 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Csnk2a1Q60737 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Csnk2a1Q60737 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Csnk2a1Q60737 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Csnk2a1Q60737 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Csnk2a1Q60737 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Csnk2a1Q60737 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Csnk2a1Q60737 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Csnk2a1Q60737 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Csnk2a1Q60737 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Csnk2a1Q60737 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Csnk2a1Q60737 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Csnk2a1Q60737 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Csnk2a1Q60737 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Csnk2a1Q60737 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Csnk2a1Q60737 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Csnk2a1Q60737 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Csnk2a1Q60737 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Csnk2a1Q60737 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Csnk2a1Q60737 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Csnk2a1Q60737 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Csnk2a1Q60737 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Csnk2a1Q60737 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Csnk2a1Q60737 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Csnk2a1Q60737 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Csnk2a1Q60737 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Csnk2a1Q60737 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Csnk2a1Q60737 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Csnk2a1Q60737 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Csnk2a1Q60737 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Csnk2a1Q60737 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Csnk2a1Q60737 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Csnk2a1Q60737 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Csnk2a1Q60737 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Csnk2a1Q60737 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Csnk2a1Q60737 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Csnk2a1Q60737 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Csnk2a1Q60737 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Csnk2a1Q60737 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Csnk2a1Q60737 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Csnk2a1Q60737 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Csnk2a1Q60737 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Csnk2a1Q60737 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Csnk2a1Q60737 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Csnk2a1Q60737 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Csnk2a1Q60737 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Csnk2a1Q60737 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Csnk2a1Q60737 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Csnk2a1Q60737 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Csnk2a1Q60737 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Csnk2a1Q60737 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Csnk2a1Q60737 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Csnk2a1Q60737 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms