Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI3

Rnf123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf123Q5XPI3 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf123Q5XPI3 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms