Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms