Protein–RNA interactions for Protein: Q5RIS0

Gm11487, Novel protein, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11487Q5RIS0 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm11487Q5RIS0 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm11487Q5RIS0 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm11487Q5RIS0 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm11487Q5RIS0 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm11487Q5RIS0 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm11487Q5RIS0 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm11487Q5RIS0 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm11487Q5RIS0 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm11487Q5RIS0 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm11487Q5RIS0 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm11487Q5RIS0 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm11487Q5RIS0 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm11487Q5RIS0 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm11487Q5RIS0 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm11487Q5RIS0 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm11487Q5RIS0 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm11487Q5RIS0 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm11487Q5RIS0 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm11487Q5RIS0 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm11487Q5RIS0 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm11487Q5RIS0 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm11487Q5RIS0 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm11487Q5RIS0 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm11487Q5RIS0 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm11487Q5RIS0 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm11487Q5RIS0 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm11487Q5RIS0 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm11487Q5RIS0 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm11487Q5RIS0 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm11487Q5RIS0 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm11487Q5RIS0 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm11487Q5RIS0 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm11487Q5RIS0 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm11487Q5RIS0 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm11487Q5RIS0 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm11487Q5RIS0 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm11487Q5RIS0 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm11487Q5RIS0 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm11487Q5RIS0 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm11487Q5RIS0 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm11487Q5RIS0 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm11487Q5RIS0 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm11487Q5RIS0 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm11487Q5RIS0 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm11487Q5RIS0 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm11487Q5RIS0 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm11487Q5RIS0 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm11487Q5RIS0 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm11487Q5RIS0 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm11487Q5RIS0 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm11487Q5RIS0 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm11487Q5RIS0 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm11487Q5RIS0 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm11487Q5RIS0 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm11487Q5RIS0 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm11487Q5RIS0 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm11487Q5RIS0 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm11487Q5RIS0 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm11487Q5RIS0 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm11487Q5RIS0 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm11487Q5RIS0 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm11487Q5RIS0 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm11487Q5RIS0 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm11487Q5RIS0 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm11487Q5RIS0 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm11487Q5RIS0 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm11487Q5RIS0 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm11487Q5RIS0 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm11487Q5RIS0 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm11487Q5RIS0 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm11487Q5RIS0 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm11487Q5RIS0 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm11487Q5RIS0 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm11487Q5RIS0 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm11487Q5RIS0 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm11487Q5RIS0 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm11487Q5RIS0 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm11487Q5RIS0 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm11487Q5RIS0 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm11487Q5RIS0 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm11487Q5RIS0 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm11487Q5RIS0 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm11487Q5RIS0 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm11487Q5RIS0 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm11487Q5RIS0 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm11487Q5RIS0 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm11487Q5RIS0 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm11487Q5RIS0 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm11487Q5RIS0 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm11487Q5RIS0 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm11487Q5RIS0 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm11487Q5RIS0 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm11487Q5RIS0 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm11487Q5RIS0 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm11487Q5RIS0 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm11487Q5RIS0 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm11487Q5RIS0 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm11487Q5RIS0 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm11487Q5RIS0 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms