Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWD4

Gm20816, Predicted gene, 20816, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20816Q5FWD4 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm20816Q5FWD4 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm20816Q5FWD4 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm20816Q5FWD4 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm20816Q5FWD4 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm20816Q5FWD4 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm20816Q5FWD4 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm20816Q5FWD4 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm20816Q5FWD4 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20816Q5FWD4 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20816Q5FWD4 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20816Q5FWD4 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20816Q5FWD4 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20816Q5FWD4 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20816Q5FWD4 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20816Q5FWD4 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20816Q5FWD4 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20816Q5FWD4 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20816Q5FWD4 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20816Q5FWD4 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20816Q5FWD4 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20816Q5FWD4 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20816Q5FWD4 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20816Q5FWD4 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20816Q5FWD4 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20816Q5FWD4 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20816Q5FWD4 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20816Q5FWD4 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20816Q5FWD4 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20816Q5FWD4 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20816Q5FWD4 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20816Q5FWD4 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20816Q5FWD4 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20816Q5FWD4 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20816Q5FWD4 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20816Q5FWD4 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20816Q5FWD4 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20816Q5FWD4 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20816Q5FWD4 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20816Q5FWD4 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20816Q5FWD4 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20816Q5FWD4 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20816Q5FWD4 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20816Q5FWD4 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20816Q5FWD4 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20816Q5FWD4 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20816Q5FWD4 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20816Q5FWD4 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20816Q5FWD4 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20816Q5FWD4 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20816Q5FWD4 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20816Q5FWD4 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20816Q5FWD4 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20816Q5FWD4 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20816Q5FWD4 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20816Q5FWD4 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20816Q5FWD4 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20816Q5FWD4 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20816Q5FWD4 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20816Q5FWD4 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20816Q5FWD4 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20816Q5FWD4 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20816Q5FWD4 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20816Q5FWD4 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20816Q5FWD4 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20816Q5FWD4 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20816Q5FWD4 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20816Q5FWD4 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20816Q5FWD4 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20816Q5FWD4 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20816Q5FWD4 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20816Q5FWD4 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20816Q5FWD4 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20816Q5FWD4 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20816Q5FWD4 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20816Q5FWD4 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20816Q5FWD4 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20816Q5FWD4 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20816Q5FWD4 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20816Q5FWD4 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20816Q5FWD4 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20816Q5FWD4 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20816Q5FWD4 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20816Q5FWD4 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20816Q5FWD4 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20816Q5FWD4 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20816Q5FWD4 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20816Q5FWD4 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20816Q5FWD4 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20816Q5FWD4 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20816Q5FWD4 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20816Q5FWD4 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20816Q5FWD4 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20816Q5FWD4 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20816Q5FWD4 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20816Q5FWD4 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20816Q5FWD4 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20816Q5FWD4 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20816Q5FWD4 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm20816Q5FWD4 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms