Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ttc9Q3V038 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Ttc9Q3V038 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
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Ttc9Q3V038 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Ttc9Q3V038 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Ttc9Q3V038 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ttc9Q3V038 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms