Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnpc3Q3UZ01 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnpc3Q3UZ01 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnpc3Q3UZ01 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnpc3Q3UZ01 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnpc3Q3UZ01 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnpc3Q3UZ01 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnpc3Q3UZ01 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnpc3Q3UZ01 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnpc3Q3UZ01 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnpc3Q3UZ01 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnpc3Q3UZ01 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnpc3Q3UZ01 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnpc3Q3UZ01 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnpc3Q3UZ01 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnpc3Q3UZ01 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnpc3Q3UZ01 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnpc3Q3UZ01 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnpc3Q3UZ01 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnpc3Q3UZ01 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnpc3Q3UZ01 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnpc3Q3UZ01 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnpc3Q3UZ01 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnpc3Q3UZ01 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnpc3Q3UZ01 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnpc3Q3UZ01 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnpc3Q3UZ01 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnpc3Q3UZ01 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnpc3Q3UZ01 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnpc3Q3UZ01 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnpc3Q3UZ01 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnpc3Q3UZ01 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnpc3Q3UZ01 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnpc3Q3UZ01 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnpc3Q3UZ01 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnpc3Q3UZ01 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnpc3Q3UZ01 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnpc3Q3UZ01 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnpc3Q3UZ01 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnpc3Q3UZ01 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnpc3Q3UZ01 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnpc3Q3UZ01 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnpc3Q3UZ01 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnpc3Q3UZ01 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnpc3Q3UZ01 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnpc3Q3UZ01 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnpc3Q3UZ01 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnpc3Q3UZ01 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnpc3Q3UZ01 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnpc3Q3UZ01 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnpc3Q3UZ01 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnpc3Q3UZ01 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnpc3Q3UZ01 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnpc3Q3UZ01 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnpc3Q3UZ01 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnpc3Q3UZ01 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnpc3Q3UZ01 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnpc3Q3UZ01 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnpc3Q3UZ01 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnpc3Q3UZ01 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnpc3Q3UZ01 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnpc3Q3UZ01 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnpc3Q3UZ01 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnpc3Q3UZ01 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnpc3Q3UZ01 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnpc3Q3UZ01 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnpc3Q3UZ01 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnpc3Q3UZ01 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnpc3Q3UZ01 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnpc3Q3UZ01 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnpc3Q3UZ01 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnpc3Q3UZ01 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnpc3Q3UZ01 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnpc3Q3UZ01 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnpc3Q3UZ01 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnpc3Q3UZ01 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms