Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sec31aQ3UPL0 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sec31aQ3UPL0 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
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