Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tmem253Q3UNB8 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms