Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms