Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms