Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3E2

Fam117b, Protein FAM117B, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam117bQ3U3E2 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam117bQ3U3E2 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam117bQ3U3E2 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam117bQ3U3E2 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam117bQ3U3E2 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam117bQ3U3E2 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam117bQ3U3E2 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam117bQ3U3E2 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam117bQ3U3E2 AC107757.2-201ENSMUST00000226370 1466 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam117bQ3U3E2 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam117bQ3U3E2 Wdr46-ps-201ENSMUST00000200591 1712 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam117bQ3U3E2 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam117bQ3U3E2 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam117bQ3U3E2 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam117bQ3U3E2 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam117bQ3U3E2 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam117bQ3U3E2 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam117bQ3U3E2 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam117bQ3U3E2 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam117bQ3U3E2 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam117bQ3U3E2 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam117bQ3U3E2 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam117bQ3U3E2 Olfr1060-ps1-201ENSMUST00000118335 943 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam117bQ3U3E2 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam117bQ3U3E2 Gm3931-201ENSMUST00000119038 455 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam117bQ3U3E2 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam117bQ3U3E2 Gm13565-201ENSMUST00000133596 700 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam117bQ3U3E2 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam117bQ3U3E2 Gm20389-201ENSMUST00000174217 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam117bQ3U3E2 Gm26550-201ENSMUST00000180699 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam117bQ3U3E2 Gm28807-201ENSMUST00000187799 471 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam117bQ3U3E2 Gm20781-201ENSMUST00000193154 693 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam117bQ3U3E2 Gm6236-201ENSMUST00000193785 1009 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam117bQ3U3E2 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam117bQ3U3E2 Gm21736-201ENSMUST00000195399 693 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam117bQ3U3E2 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam117bQ3U3E2 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam117bQ3U3E2 Reg1-202ENSMUST00000204601 766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam117bQ3U3E2 Reg1-203ENSMUST00000204687 904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam117bQ3U3E2 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam117bQ3U3E2 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam117bQ3U3E2 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam117bQ3U3E2 AC116589.3-202ENSMUST00000221770 649 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam117bQ3U3E2 AC116589.6-201ENSMUST00000222252 649 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam117bQ3U3E2 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam117bQ3U3E2 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam117bQ3U3E2 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam117bQ3U3E2 Olfr787-201ENSMUST00000077836 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam117bQ3U3E2 Gm36930-201ENSMUST00000195431 2376 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam117bQ3U3E2 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam117bQ3U3E2 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam117bQ3U3E2 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam117bQ3U3E2 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam117bQ3U3E2 Olfr1055-203ENSMUST00000213564 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam117bQ3U3E2 AC132833.1-202ENSMUST00000228875 1690 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam117bQ3U3E2 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam117bQ3U3E2 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam117bQ3U3E2 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam117bQ3U3E2 Psmc1-201ENSMUST00000021595 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam117bQ3U3E2 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam117bQ3U3E2 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam117bQ3U3E2 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam117bQ3U3E2 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam117bQ3U3E2 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam117bQ3U3E2 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam117bQ3U3E2 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam117bQ3U3E2 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam117bQ3U3E2 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam117bQ3U3E2 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam117bQ3U3E2 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam117bQ3U3E2 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam117bQ3U3E2 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam117bQ3U3E2 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam117bQ3U3E2 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam117bQ3U3E2 Il15ra-210ENSMUST00000128156 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam117bQ3U3E2 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam117bQ3U3E2 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam117bQ3U3E2 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam117bQ3U3E2 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam117bQ3U3E2 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam117bQ3U3E2 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam117bQ3U3E2 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam117bQ3U3E2 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam117bQ3U3E2 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam117bQ3U3E2 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam117bQ3U3E2 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam117bQ3U3E2 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam117bQ3U3E2 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam117bQ3U3E2 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam117bQ3U3E2 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam117bQ3U3E2 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam117bQ3U3E2 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam117bQ3U3E2 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam117bQ3U3E2 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam117bQ3U3E2 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam117bQ3U3E2 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam117bQ3U3E2 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam117bQ3U3E2 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam117bQ3U3E2 Gm11583-201ENSMUST00000132296 466 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam117bQ3U3E2 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms