Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.9 ms