Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms