Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTD8

Gm21440, Predicted gene, 20737, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21440Q3TTD8 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm21440Q3TTD8 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm21440Q3TTD8 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm21440Q3TTD8 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm21440Q3TTD8 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm21440Q3TTD8 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm21440Q3TTD8 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm21440Q3TTD8 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm21440Q3TTD8 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm21440Q3TTD8 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm21440Q3TTD8 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm21440Q3TTD8 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm21440Q3TTD8 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm21440Q3TTD8 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm21440Q3TTD8 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm21440Q3TTD8 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm21440Q3TTD8 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm21440Q3TTD8 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm21440Q3TTD8 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm21440Q3TTD8 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm21440Q3TTD8 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm21440Q3TTD8 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm21440Q3TTD8 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm21440Q3TTD8 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm21440Q3TTD8 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm21440Q3TTD8 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm21440Q3TTD8 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm21440Q3TTD8 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm21440Q3TTD8 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm21440Q3TTD8 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21440Q3TTD8 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21440Q3TTD8 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21440Q3TTD8 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21440Q3TTD8 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21440Q3TTD8 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21440Q3TTD8 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21440Q3TTD8 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21440Q3TTD8 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21440Q3TTD8 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21440Q3TTD8 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21440Q3TTD8 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21440Q3TTD8 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21440Q3TTD8 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21440Q3TTD8 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21440Q3TTD8 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21440Q3TTD8 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21440Q3TTD8 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21440Q3TTD8 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21440Q3TTD8 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21440Q3TTD8 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21440Q3TTD8 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21440Q3TTD8 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21440Q3TTD8 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21440Q3TTD8 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21440Q3TTD8 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21440Q3TTD8 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21440Q3TTD8 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21440Q3TTD8 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21440Q3TTD8 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21440Q3TTD8 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21440Q3TTD8 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21440Q3TTD8 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21440Q3TTD8 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21440Q3TTD8 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21440Q3TTD8 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21440Q3TTD8 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21440Q3TTD8 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21440Q3TTD8 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21440Q3TTD8 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21440Q3TTD8 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21440Q3TTD8 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21440Q3TTD8 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21440Q3TTD8 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21440Q3TTD8 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21440Q3TTD8 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21440Q3TTD8 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21440Q3TTD8 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21440Q3TTD8 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21440Q3TTD8 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21440Q3TTD8 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21440Q3TTD8 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21440Q3TTD8 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21440Q3TTD8 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21440Q3TTD8 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm21440Q3TTD8 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm21440Q3TTD8 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm21440Q3TTD8 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm21440Q3TTD8 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm21440Q3TTD8 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm21440Q3TTD8 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm21440Q3TTD8 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm21440Q3TTD8 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm21440Q3TTD8 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm21440Q3TTD8 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm21440Q3TTD8 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm21440Q3TTD8 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm21440Q3TTD8 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm21440Q3TTD8 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm21440Q3TTD8 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm21440Q3TTD8 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms