Protein–RNA interactions for Protein: Q3TR08

Fndc4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc4Q3TR08 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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