Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c3Q3TMP1 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c3Q3TMP1 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c3Q3TMP1 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c3Q3TMP1 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c3Q3TMP1 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c3Q3TMP1 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c3Q3TMP1 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c3Q3TMP1 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c3Q3TMP1 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c3Q3TMP1 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c3Q3TMP1 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c3Q3TMP1 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c3Q3TMP1 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c3Q3TMP1 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c3Q3TMP1 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c3Q3TMP1 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c3Q3TMP1 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c3Q3TMP1 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c3Q3TMP1 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c3Q3TMP1 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c3Q3TMP1 Olfr1415-202ENSMUST00000204009 2815 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c3Q3TMP1 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c3Q3TMP1 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c3Q3TMP1 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c3Q3TMP1 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c3Q3TMP1 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c3Q3TMP1 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c3Q3TMP1 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c3Q3TMP1 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c3Q3TMP1 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c3Q3TMP1 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c3Q3TMP1 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c3Q3TMP1 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c3Q3TMP1 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c3Q3TMP1 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c3Q3TMP1 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c3Q3TMP1 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c3Q3TMP1 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3c3Q3TMP1 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3c3Q3TMP1 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3c3Q3TMP1 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3c3Q3TMP1 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3c3Q3TMP1 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3c3Q3TMP1 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3c3Q3TMP1 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3c3Q3TMP1 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3c3Q3TMP1 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3c3Q3TMP1 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3c3Q3TMP1 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3c3Q3TMP1 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3c3Q3TMP1 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3c3Q3TMP1 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3c3Q3TMP1 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3c3Q3TMP1 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3c3Q3TMP1 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3c3Q3TMP1 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3c3Q3TMP1 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3c3Q3TMP1 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3c3Q3TMP1 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3c3Q3TMP1 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3c3Q3TMP1 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3c3Q3TMP1 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3c3Q3TMP1 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3c3Q3TMP1 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3c3Q3TMP1 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Gtf3c3Q3TMP1 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gtf3c3Q3TMP1 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gtf3c3Q3TMP1 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Gtf3c3Q3TMP1 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Gtf3c3Q3TMP1 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gtf3c3Q3TMP1 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gtf3c3Q3TMP1 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gtf3c3Q3TMP1 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gtf3c3Q3TMP1 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gtf3c3Q3TMP1 Ap3b2-205ENSMUST00000152355 3168 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf3c3Q3TMP1 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf3c3Q3TMP1 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf3c3Q3TMP1 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf3c3Q3TMP1 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf3c3Q3TMP1 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gtf3c3Q3TMP1 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gtf3c3Q3TMP1 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf3c3Q3TMP1 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf3c3Q3TMP1 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf3c3Q3TMP1 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf3c3Q3TMP1 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf3c3Q3TMP1 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf3c3Q3TMP1 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf3c3Q3TMP1 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf3c3Q3TMP1 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf3c3Q3TMP1 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms