Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms