Protein–RNA interactions for Protein: Q3LR78

Zbtb38, CtBP-interacting BTB zinc finger protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb38Q3LR78 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zbtb38Q3LR78 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zbtb38Q3LR78 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zbtb38Q3LR78 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Zbtb38Q3LR78 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zbtb38Q3LR78 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zbtb38Q3LR78 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zbtb38Q3LR78 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zbtb38Q3LR78 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zbtb38Q3LR78 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zbtb38Q3LR78 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zbtb38Q3LR78 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zbtb38Q3LR78 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zbtb38Q3LR78 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zbtb38Q3LR78 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Zbtb38Q3LR78 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zbtb38Q3LR78 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zbtb38Q3LR78 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zbtb38Q3LR78 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zbtb38Q3LR78 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Zbtb38Q3LR78 Gm14603-201ENSMUST00000121275 448 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Zbtb38Q3LR78 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zbtb38Q3LR78 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zbtb38Q3LR78 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Zbtb38Q3LR78 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zbtb38Q3LR78 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Zbtb38Q3LR78 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zbtb38Q3LR78 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Zbtb38Q3LR78 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Zbtb38Q3LR78 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zbtb38Q3LR78 BC028528-202ENSMUST00000090476 809 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zbtb38Q3LR78 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Gm11569-201ENSMUST00000105057 869 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Serpinb1a-201ENSMUST00000076352 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms