Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Samd11Q1RNF8 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms