Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.8 ms