Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms