Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms